9月底10月初在美国白宫所传播的新型冠状病毒SARS-CoV-2序列被研究人员披露，研究发现这一毒株是一种在美国很罕见的毒株，纽约时报进行了深入报道。

今年大选的10月惊奇是美国总统确诊COVID-19，但是白宫对这一事件讳莫如深。纽约时报联合我多次提及的Fred Hutch研究所著名病毒生物信息学专家Trevor Bedford报道了这次聚集传播事件的病毒序列和序列比对，Bedford在Nextstrain上传了这些序列，并撰写了研究论文草稿。

10月初白宫出现了50人感染的聚集传播事件，而这项研究获得了在这次传播事件中的两名记者Shear和Drago的样品。Shear在空军一号与总统有过近距离接触，而Drago参加了Barrett大法官提名庆典。两人均授权了该研究。研究发现这两名记者的毒株高度同源，由此确认了这两人感染的病毒来源相同，被称为白宫株（WH1/2）。

这一毒株具有5个特征性核苷酸突变，这5个突变分别为3037T，7936T，16260T，20402T和28821A。7936T和20402T尤为罕见，在所有病毒序列中，分别只有0.04%和0.02%具有该突变。因此这一具有5个突变位点的病毒序列与目前流行的病毒序列相比具有显著特异性。

有意思的是，通过序列比对，研究发现这一毒株与目前美国流行的毒株具有共同的祖先（20C），这一祖先是春季在美国（康涅狄格和纽约株）、加拿大和新西兰的流行毒株，但在5月之后这一毒株逐渐减少。而白宫株WH1/2的演变则是完全隐匿的。

研究由此指出，虽然Nextstrain中有美国全境的35000个病毒序列，但是依然可能有遗漏的病毒序列没有被检测出来，这些病毒的传播链可能未被发现从而在民间持续传播；与此同时，美国大部分地区已放弃contact tracing。

但由于白宫株序列的稀有性和独特性，因此则会较容易判断从白宫发源的后续传播链的流行情况。